Normal ang mga mutasyon
Ang paglitaw ng mga bagong variant ng viral ay walang kakaiba: ang mga virus - kabilang ang Sars-CoV-2 pathogen - ay paulit-ulit na binabago ang kanilang genetic na materyal nang random sa panahon ng pagtitiklop. Karamihan sa mga mutasyon na ito ay walang kabuluhan. Ang ilan, gayunpaman, ay kapaki-pakinabang para sa virus at naging matatag.
Sa ganitong paraan, mabilis na nakakaangkop ang mga virus sa kapaligiran at sa kanilang host. Ito ay bahagi ng kanilang evolutionary strategy.
Inuri ng WHO ang mga bagong variant ayon sa mga sumusunod na kategorya:
- Mga variant under monitoring (VBM) – Mga variant na may mga pagbabago sa genetic na maaaring mangahulugan ng mas mataas na panganib, ngunit may mga epekto na hindi pa rin malinaw.
- Variant of interest (VOI): Mga variant na may genetic features na predictive ng mas mataas na transmissibility, bypassing immunity o diagnostic tests, o mas malalang sakit kumpara sa mga naunang form.
- Variant of high consequence (VOHC) – Variant na may mataas na kinahinatnan: Variant kung saan walang proteksyon ang mga kasalukuyang bakuna. Sa ngayon, wala pang mga variant ng SARS-CoV-2 sa kategoryang ito.
Ang mga variation ng virus ay pinagsama-sama sa tinatawag na clades o lineages - kaya sistematikong itinatala at idodokumento ng mga mananaliksik ang "family tree of the coronavirus". Ang bawat variant ay nailalarawan ayon sa mga namamana nitong katangian at itinalaga ang kumbinasyon ng titik-numero. Gayunpaman, ang pagtatalaga na ito ay hindi nagpapahiwatig kung ang isang partikular na strain ng virus ay mas mapanganib kaysa sa isa pa.
Paano nagbabago ang coronavirus?
Mayroong dalawang paraan para "matagumpay" na mag-evolve ang coronavirus: Nagbabago ito sa paraang mas mahusay itong makapasok sa selula ng tao, kaya nagiging mas nakakahawa, o sinusubukan nitong "makatakas" sa ating immune system sa pamamagitan ng pag-aangkop:
Escape mutation: Ito ang mga pagbabagong nagbibigay-daan sa coronavirus na "makatakas" mula sa immune system. Pagkatapos ay binabago ng virus ang panlabas na anyo nito sa paraang ang mga antibodies (nabuo na) ng isang paunang impeksyon o pagbabakuna ay hindi na nagagawang "kilalanin" at neutralisahin ito. Ito ay tinutukoy din bilang "escape mutations" o "immune escape". Ang pangalawang impeksyon ay maaaring maging mas malamang.
Paano nagkakaroon ng mga variant ng virus?
Habang tumatagal ang pandemic, mas maraming impeksyon, mas maraming variation at mutations ng coronavirus.
Ang Corona pandemic ay nagpapatuloy na ngayon sa loob ng magandang dalawang taon: Simula noong Enero 05, 2022, ang Johns Hopkins Coronavirus Resource Center (CRC) ay nag-uulat na ngayon ng humigit-kumulang 296 milyong kaso ng impeksyon sa buong mundo.
Sapat na pagkakataon para sa coronavirus na makaipon ng maraming pagbabago (variations) sa genetic na materyal.
Ang napakalaking bilang ng mga kaso na ito - at ang mga kasamang genetic na pagbabago sa Sars-CoV-2 - ay makikita sa malawak na ngayong pagkalat ng malaking bilang ng mga bagong variant ng virus:
Delta: Ang B.1.617.2 angkan
Ang delta variant (B.1.617.2) ng Sars-CoV-2 ay mabilis ding kumalat sa Germany nitong mga nakaraang buwan (fall 2021). Ito ay unang natuklasan sa India at nahahati sa tatlong sub-variant na pinagsasama ang ilang mga pagbabago sa katangian.
Sa isang banda, ito ay mga pagbabago sa spike protein, na itinuturing na "susi" para sa selula ng tao. Sa kabilang banda, ang B.1.617 ay nagpapakita rin ng mga pagbabago na tinatalakay bilang isang (posibleng) escape mutation.
Sa partikular, pinagsasama ng B.1.617 ang mga sumusunod na nauugnay na mutasyon, bukod sa iba pa:
Mutation D614G: Maaari nitong gawing mas nakakahawa ang coronavirus. Ang paunang pagmomodelo ay nagmumungkahi na ginagawa nitong ang B.1.617 ay hindi bababa sa kasing dali na mailipat gaya ng lubos na nakakahawa na alpha variant (B.1.1.7).
Mutation P681R: Iniuugnay din ng mga mananaliksik na may posibleng tumaas na virulence.
Mutation E484K: Natagpuan din sa beta variant (B.1.351) at gamma variant (P.1). Pinaghihinalaang ginagawang hindi gaanong sensitibo ang virus sa pag-neutralize ng mga antibodies na nabuo na.
Mutation L452R: Tinatalakay din ito bilang isang posibleng escape mutation. Ang mga strain ng Coronavirus na may L452R mutation ay bahagyang lumalaban sa ilang antibodies sa mga eksperimento sa laboratoryo.
Ang delta variant, na nangingibabaw sa Europe hanggang ngayon, ay tila inilipat din sa malalaking hakbang ng napaka-nakakahawa na variant ng omicron.
Omikron: Ang B.1.1.529 angkan
Ang Omikron variant ay ang pinakahuling coronavirus mutation, na unang natuklasan sa Botswana noong Nobyembre 2021. Opisyal na itong inuri bilang isang novel variant-of-concern ng World Health Organization (WHO).
Eris: Ang EG.5 angkan
Ang EG.5 na variant ng coronavirus ay mula sa linya ng Omikron. Una itong natukoy noong Pebrero 2023. Mula noon, kumalat na ito sa iba't ibang bansa sa buong mundo at nangingibabaw sa pinangyarihan ng impeksyon sa maraming lugar. Tinatawag din itong Eris, ayon sa Greek goddess of discord at alitan.
Ang EG.5 ay bumaba mula sa mga variant ng omicron na XBB.1.9.2. at XBB.1.5, ngunit mayroon ding novel mutation sa spike protein (F456L). Ang EG.5.1 subline ay nagdadala din ng isa pang Q52H mutation.
Mas mapanganib ba ang EG.5 kaysa sa mga nakaraang variant?
Sa paglitaw ng EG.5, ang bilang ng mga kaso ng impeksyon sa corona ay muling tumataas, at kasama nito, ang mga pagpapaospital. Sa ngayon, wala pang naiulat na pagbabago sa kalubhaan ng sakit, ayon sa WHO. Samakatuwid, inuri ng WHO ang EG.5 bilang variant of interest (VOI), ngunit hindi variant of concern (VOC).
Ang mga katugmang booster vaccine para sa taglagas ay hindi tiyak na naka-target sa EG.5, ngunit sa isang malapit na nauugnay na viral lineage (XBB.1.5 ). Ang mga maagang klinikal na pag-aaral ay nagpapahiwatig na ang booster vaccination ay epektibo rin laban sa EG.5.
Pirola: Ang lahi ng BA.2.86
Ang BA.2.86 na variant ng virus ay isa ring omicron derivative. Naiiba ito sa putative predecessor na variant nito na BA.2 sa pamamagitan ng 34 na bagong mutasyon sa spike protein, na ginagawa itong katulad na divergent mula sa mga naunang anyo tulad ng Omicron ay pinakahuling.
Gaano kadalas ang BA.2.86?
Sa ngayon, ang variant ay natagpuan lamang sa ilang tao. Gayunpaman, ang maliit na pagsubok ay ginagawa na ngayon sa pangkalahatan. Sa partikular, bihira ang mga detalyadong pagsusuri na tumutukoy sa partikular na variant ng viral. Ang katotohanan na ang mga kilalang kaso ay nagmula sa tatlong kontinente (North America, Asia at Europe) at hindi direktang nauugnay ay nagpapahiwatig na ang Pirola ay kumalat nang hindi napapansin.
Mas mapanganib ba ang BA.2.86 kaysa sa mga naunang variant?
Ang mga inangkop na bakuna ba ay epektibo laban sa BA.2.86?
Ang mga bakunang available mula Setyembre ay na-optimize para sa XBB.1.5 na variant. Ang spike protein nito ay naiiba sa Pirola sa 36 na seksyon. Samakatuwid, ang proteksyon laban sa impeksyon ay malamang na mabawasan. Gayunpaman, naniniwala ang mga eksperto na nananatili pa rin ang proteksyon laban sa mga malubhang kurso.
Iba pang mga kilalang variant ng virus
Ang mga karagdagang variant ng virus ng Sars-CoV-2 ay nabuo din na naiiba sa wild type - ngunit hindi kasalukuyang inuri ng mga eksperto ang mga ito bilang mga VOC. Ang mga strain ng virus na ito ay tinutukoy bilang "Variants of Interest" (VOI).
Hindi pa malinaw kung ano ang maaaring maging epekto ng mga umuusbong na VOI na ito sa pandemya. Kung sila ay igiit at manaig laban sa mga nagpapalipat-lipat na mga strain ng virus, sila rin ay maaaring ma-upgrade sa kaukulang mga VOC.
Mga variant ng partikular na interes
- BA.4: Omicron subtype, unang natuklasan sa South Africa.
- BA.5: Omicron subtype, unang natuklasan sa South Africa.
Mga variant sa ilalim ng pagsubaybay
Ang tinatawag na "Variants under monitoring" (VUM) ay nasa pinalawak na pagtutok - gayunpaman, may kakulangan pa rin ng maaasahan at sistematikong data sa mga ito. Sa karamihan ng mga kaso, tanging katibayan ng kanilang pag-iral lamang ang magagamit. Kabilang sa mga ito ang mga variant na paminsan-minsang nagaganap pati na rin ang mga "binago" na inapo ng mga kilalang mutasyon na.
Ayon sa ECDC, ang mga bihirang VUM na ito ay kasalukuyang kinabibilangan ng:
- XD – variant na unang nakita sa France.
- BA.3 – subtype ng variant ng Omikron, unang nakita sa South Africa.
- BA.2 + L245X – subtype ng variant ng omicron na hindi alam ang pinagmulan.
Mga na-downgrade na variant ng virus
Tulad ng dinamikong pag-unlad ng mga kaganapan sa impeksyon sa patuloy na pandemya ng Corona, gayundin ang pang-agham na pag-unawa at pagtatasa ng mga variant ng virus na laganap sa iba't ibang yugto ng pandemya.
Alpha: Ang B.1.1.7 angkan
Ang variant ng Coronavirus na Alpha (B.1.1.7) ay halos hindi na umiikot sa Europa, ayon sa mga opisyal. Ang Alpha ay unang nakita sa United Kingdom at, simula sa timog-silangang England, ay lalong lumalaganap sa kontinente ng Europa mula noong taglagas ng 2020.
Ang B 1.1.7 lineage ay may kapansin-pansing mataas na bilang ng mga pagbabago sa gene, na may 17 mutations. Ang ilan sa mga mutasyon na ito ay nakaapekto sa spike protein - lubhang makabuluhang kabilang ang N501Y mutation.
Ang B.1.1.7 ay inaakalang humigit-kumulang 35 porsiyentong mas nakakahawa kaysa sa wild-type na Sars-CoV-2, at ang naobserbahang dami ng namamatay mula sa impeksyon (nang walang paunang pagbabakuna) ay tumaas din. Gayunpaman, ang mga magagamit na bakuna ay nagbigay ng matatag na proteksyon.
Matindi ang pagtanggi ng Alpha sa kasunduan sa mga opisyal na ahensya (ECDC, CDC at WHO).
Beta: Ang B.1.351 lineage
Ang mutant ay malamang na nabuo bilang isang resulta ng isang mataas na infestation ng populasyon ng South Africa na may virus. Naitala na ng South Africa ang malakihang paglaganap ng corona sa mga buwan ng tag-init ng 2020. Sa partikular na mga township, malamang na nakahanap ang virus ng mga mainam na kondisyon para kumalat nang mabilis.
Nangangahulugan ito na napakaraming tao ang immune na sa orihinal na anyo ng Sars-CoV-2 - kailangang magbago ang virus. Tinutukoy ng mga mananaliksik ang ganitong sitwasyon bilang evolutionary pressure. Bilang resulta, nanaig ang isang bagong variant ng virus na higit sa orihinal na anyo dahil, bukod sa iba pang mga bagay, ito ay mas nakakahawa.
Ang paunang data ay nagmumungkahi na ang Comirnaty vaccine ay mayroon ding mataas na bisa laban sa B.1351 lineage. Ang VaxZevria, sa kabilang banda, ay maaaring nabawasan ang bisa, ayon sa isang paunang pahayag ng mga may-akda na Madhi et al.
Malaki ang pagbaba ng Beta sa kasunduan sa mga opisyal na ahensya (ECDC, CDC pati na rin sa WHO).
Gamma: Ang linyang P.1
Ang isa pang VOC na tinatawag na P.1 – na dating kilala bilang B.1.1.28.1, ngayon ay tinatawag na Gamma – ay unang natuklasan sa Brazil noong Disyembre 2020. Ang P.1 ay mayroon ding mahalagang N501Y mutation sa genome nito. Kaya, ang P.1 virus strain ay itinuturing na lubhang nakakahawa.
Ang Gamma ay orihinal na umunlad at kumalat sa rehiyon ng Amazon. Ang pagkalat ng variant ay kasabay ng pagtaas ng mga ospital na nauugnay sa Covid-19 sa rehiyong ito sa kalagitnaan ng Disyembre 2020.
Bumaba nang husto ang Gamma bilang pagsang-ayon sa mga eksperto mula sa ECDC, CDC, at WHO.
Mga karagdagang de-escalate na variant
Kahit na ang isang malaking bilang ng mga bagong variant ng virus ay nakilala na ngayon, hindi ito awtomatikong nangangahulugan ng isang mas malaking banta. Ang impluwensya ng naturang mga variant sa (global) na saklaw ng impeksyon ay maliit, o sila ay pinigilan. Kabilang dito ang:
- Epsilon: B.1.427 pati na rin ang B.1.429 – unang natuklasan sa California.
- Eta: Nakita sa maraming bansa (B.1.525).
- Theta: Ang dating itinalagang P.3, ngayon ay ibinaba, unang natuklasan sa Pilipinas.
- Kappa: Unang nakita sa India (B.1.617.1).
- Lambda: Unang natuklasan sa Peru noong Disyembre 2020 (C.37).
- Mu: Unang natuklasan sa Colombia noong Enero 2021 (B.1.621).
- Iota: Unang natuklasan sa USA sa New York metropolitan area (B.1.526).
- Zeta: Ang dating itinalagang P.2, ngayon ay ibinaba, unang natuklasan sa Brazil.
Gaano kabilis mag-mutate ang Sars-CoV-2?
Sa hinaharap, ang Sars-CoV-2 ay patuloy na aangkop sa immune system ng tao at sa isang (bahagyang) nabakunahang populasyon sa pamamagitan ng mutasyon. Kung gaano ito kabilis mangyari ay depende sa laki ng aktibong nahawaang populasyon.
Ang mas maraming kaso ng impeksyon - sa rehiyon, pambansa at internasyonal - mas dumarami ang coronavirus - at mas madalas na nangyayari ang mga mutasyon.
Kumpara sa iba pang mga virus, gayunpaman, ang coronavirus mutates medyo mabagal. Sa kabuuang haba ng Sars-CoV-2 genome na humigit-kumulang 30,000 base pairs, ipinapalagay ng mga eksperto ang isa hanggang dalawang mutasyon bawat buwan. Sa paghahambing, ang mga virus ng trangkaso (influenza) ay nagmu-mute ng dalawa hanggang apat na beses nang mas madalas sa parehong panahon.
Paano ko mapoprotektahan ang aking sarili mula sa mga mutation ng coronavirus?
Hindi mo maaaring partikular na maprotektahan ang iyong sarili mula sa mga indibidwal na mutation ng coronavirus - ang tanging posibilidad ay hindi mahawa.
Paano natukoy ang mga mutation ng coronavirus?
Ang Germany ay may malapit na sistema ng pag-uulat upang subaybayan ang mga nagpapalipat-lipat na mga virus ng Sars-CoV-2 - ito ay tinatawag na "integrated molecular surveillance system". Sa layuning ito, ang mga nauugnay na awtoridad sa kalusugan, ang Robert Koch Institute (RKI) at ang mga dalubhasang diagnostic laboratories ay malapit na nagtutulungan.
Paano gumagana ang sistema ng pag-uulat sa kaso ng mga pinaghihinalaang mutasyon?
Una sa lahat, ang bawat propesyonal na gumanap na positibong pagsusuri sa coronavirus ay napapailalim sa mandatoryong pag-uulat sa nauugnay na departamento ng kalusugan ng publiko. Kabilang dito ang mga pagsusuri sa coronavirus na isinagawa sa isang testing center, sa opisina ng iyong doktor, sa iyong parmasya, o kahit sa mga pasilidad ng gobyerno – gaya ng mga paaralan. Gayunpaman, ang mga pribadong pagsusuri sa sarili ay hindi kasama dito.
Para sa higit pang impormasyon sa mabilis na mga pagsusuri sa coronavirus para sa self-testing, tingnan ang aming espesyal na paksa ng Corona self-testing.
Pagkatapos, ikinukumpara ng RKI ang iniulat na data at ang resulta ng pagsusuri ng pagkakasunud-sunod sa pseudonymized form. Ang pseudonymized ay nangangahulugan na hindi posible na gumawa ng mga konklusyon tungkol sa isang indibidwal na tao. Gayunpaman, ang impormasyong ito ay bumubuo ng batayan ng data para sa mga siyentipiko at aktor sa sistema ng pangangalagang pangkalusugan upang makakuha ng tumpak na pangkalahatang-ideya ng kasalukuyang sitwasyon ng pandemya. Ito ay nagbibigay-daan sa pinakamahusay na posibleng pagtatasa ng sitwasyon upang makakuha ng mga hakbang sa patakaran (kung kinakailangan).
Ano ang isang sequencing genome analysis?
Ang isang sequencing genome analysis ay isang detalyadong genetic analysis. Sinusuri nito ang eksaktong pagkakasunud-sunod ng mga indibidwal na bloke ng gusali ng RNA sa loob ng viral genome. Nangangahulugan ito na ang Sars-CoV-2 genome, na binubuo ng humigit-kumulang 30,000 base pairs, ay na-decode at pagkatapos ay maihahambing sa wild-type na coronavirus.
Sa ganitong paraan lamang matutukoy ang mga indibidwal na mutasyon sa antas ng molekular - at posible ang isang pagtatalaga sa loob ng "coronavirus family tree".
Nilinaw din nito na hindi lahat ng bansa sa mundo ay nasusubaybayan nang detalyado ang eksaktong pagkalat ng mga partikular na variant ng coronavirus. Ang ilang kawalan ng katiyakan sa magagamit na data ng pag-uulat ay malamang.
